Ph.D proclamation curriculum vitae (IT) |
Questo sito 'DnaPromix' nasce per ospitare le principali applicazioni da me sviluppate.
Applicazioni pensate e in parte sviluppate durante le mie collaborazioni con il Cribi dell'Università di Padova e con la ditta BMR-Genomics di Padova. In particolare ho studiato il processo di ibridazione del DNA adottando il metodo Nearest Neighbor (SantaLucia, von Ahsen , Breslauer, Zuker, etc. ) e sviluppato applicazioni per determinare i parametri termodinamici di ibridazione. Queste applicazioni hanno permesso lo sviluppo di programmi per la tipizzazione dell'HLA mediante PCR e/o sequenziamento. Inoltre, queste applicazioni hanno permesso di sviluppare programmi per la creazione di primer per la reazione di PCR e la loro analisi termodinamica. Durante la collaborazione con la ditta BMR-genomics ho potuto approfondire i complessi archivi di varianti genomiche con relative frequenze e patologie associate. Con queste conoscenze ho sviluppato dei programmi (SNP-shot) che permettono l'analisi di sequenze genomiche o esomiche di singoli individui per individuare particolari polimorfismi. Questi programmi sono di proprietà di BMR-Genomics. Le conoscenze maturate in questo ambito, mi hanno permesso di sviluppare alcune applicazioni (presenti in questo sito) per l'analisi di varianti genomiche umane. Non tutte i programmi sviluppati sono stati inseriti in questo sito, alcuni sono stati sviluppati con fondi messi a disposizione da ditte o Università (esempio: programmi per analisi HLA residenti al Cribi oppure il programma SNP-Shot a BMR genomics). dr. Ivano Zara |
Some of these applications are / were also installed at Promix: CRIBI (University of Padua) |
